Linux -- это интересно

MOLDEN


Рубрика: Образовательные
Метки: | | | | | | | |
Просмотров: 450

MOLDEN — набор инструментов для трёхмерного (3D) молекулярного моделирования.

Молекулярное моделирование (Molecular modelling) — собирательное название методов исследования структуры и свойств молекул вычислительными методами с последующей визуализацией результатов, обеспечивающих их трёхмерное представление при заданных в расчётах условиях.

Первая версия MOLDEN выпущена в ноябре 1996 года, автор оригинального проекта Gijs Schaftenaar, разработка приложения продолжается по заказу голландского Центра молекулярной и биомолекулярной информатики (Center for Molecular and Biomolecular Informatics / CMBI).

MOLDEN имеет двухоконный пользовательский интерфейс и содержит стандартный функционал необходимый для визуализации молекулярных систем. Основным достоинством приложения является высокая скорость работы и совместимость с большинством популярных форматов химических структур.

MOLDEN имеет мощный редактор Z-матрицы (Z-matrix), обеспечивающий полный контроль над геометрией и позволяющий создавать молекулы с нуля, включая полипептиды. Визуализатор способен отображать молекулярные орбитали, плотность электронов и молекулярную отрицательную атомную плотность, усреднённую или ориентированную атомную плотность и многое другое...

MOLDEN полностью поддерживает работу с форматами пакетов вычислительной химии GAMESS-UK и GAMESS-US, GAUSSIAN (пакет для расчёта структуры и свойств молекулярных систем) и приложений для полуэмпирических расчётов Mopac/Ampac, а также других приложений использующих Ab initio методы расчётов.

MOLDEN имеет низкие системные требования и не требует никакого специального графического оборудования, управление ориентировано на использование мыши, частично поддерживается управление с клавиатуры. Linux-версия приложения распространяется бесплатно.

Лицензия: FREE (собственная / исходный код закрыт)

Домашняя страница

Комментариев: 1 RSS

Спасибо. А ссылка то на статью 2017 года. Будет свободное время - почитаем...

Оставьте комментарий!
Используйте нормальные имена.Войти через loginza
Если вы уже зарегистрированы как комментатор или хотите зарегистрироваться, укажите пароль и свой действующий email.
(При регистрации на указанный адрес придет письмо с кодом активации и ссылкой на ваш персональный аккаунт, где вы сможете изменить свои данные, включая адрес сайта, ник, описание, контакты и т.д.)



 
(обязательно)