Linux -- это интересно

wxMacMolPlt


Рубрика: Образовательные
Метки: | | | | | | | | |
Просмотров: 362

wxMacMolPlt — удобный C++ / wxWidgets (wxGTK) / OpenGL (GLEW) графический интерфейс (GUI) к пакету вычислительной химии GAMESS / PC GAMESS.

GAMESS-US (General Atomic and Molecular Electronic Structure System) — утилита из пакета вычислительной квантовой химии производящая расчёты при помощи нескольких методов вычислений, разработчик Iowa State University Quantum Chemistry Group.

wxMacMolPlt предоставляет весь необходимый функционал для упрощения визуализации молекулярных структур и обработки результатов квантово-механических расчётов сделанных с помощью GAMESS, без необходимости указания специальных параметров (для GAMESS) или ручного редактирования исходных файлов.

Сделанные GAMESS расчёты сохраняются в текстовой файл специального формата, wxMacMolPlt считывает всю необходимую информацию и визуализирует данные расчётов, таких как энтальпия образования, геометрические параметры, заселённость энергетических уровней, анализ электронной плотности, молекулярные орбитали, анимация колебаний и многое другое.

wxMacMolPlt автоматически определяет тип файла, сначала на основе расширения а затем на основе содержания файла. Если возникнет проблема с имеющимся форматом, то хранящиеся в файле координаты можно преобразовать в необходимый формат с помощью Open Babel (химическая экспертная система).

Открытую в wxMacMolPlt молекулярную структуру можно увеличивать и вращать (вручную или вводя координаты), можно просматривать орбитали, общую плотность электронов и молекулярные электростатические потенциалы, на двухмерной (2D) и трёхмерной (3D) модели. В зависимости от открытых данных визуализация может поддерживать анимацию, оптимизацию геометрии и прочее...

wxMacMolPlt разработан чтобы быть простым в использовании химиком-новичком, но имеется функционал который окажется полезен даже для профессиональных химиков. Просматривать молекулярные структуры можно в оконном и полноэкранном режиме, управление ориентировано на использование мыши, частично поддерживается управление с клавиатуры.

Лицензия: GNU General Public License version 2.0 (GPLv2)

Домашняя страница

Страница на github.com

Оставьте комментарий!
Используйте нормальные имена.Войти через loginza
Если вы уже зарегистрированы как комментатор или хотите зарегистрироваться, укажите пароль и свой действующий email.
(При регистрации на указанный адрес придет письмо с кодом активации и ссылкой на ваш персональный аккаунт, где вы сможете изменить свои данные, включая адрес сайта, ник, описание, контакты и т.д.)



 
(обязательно)