ZenWay - Linux сегодня!
  • Главная
  • Форум
  • Контакты
  • Архив
  • Гостевая книга
×
Поиск по сайту
ГлавнаяОбразовательныеGabedit

Gabedit

ОбразовательныеПросмотров: 3275Комментарии: 09 января 2018 г.
3D / Console / GTK / GUI / OpenGL / Комплект инструментов / Химия

Gabedit — простой C (си) / x11 / GTK / OpenGL графический интерфейс (GUI) к нескольким пакетам вычислительной химии.

Gabedit даёт удобный доступ к функционалу Gamess-US, Gaussian, Molcas, Molpro, MPQC, OpenMopac, Orca, PCGamess и Q-Chem. Для удобства пользователей в состав приложения включена утилита для просмотра и редактирования молекул в 3D-режиме (трёхмерного молекулярного моделирования).

GAMESS-US (General Atomic and Molecular Electronic Structure System) — утилита из пакета вычислительной квантовой химии производящая расчёты при помощи многих методов вычислений. Сделанные расчёты сохраняются в текстовой файл специального формата, хранящиеся в файле координаты можно преобразовать в любой удобный формат с помощью Open Babel (химическая экспертная система).

Gaussian — пакет утилит для расчёта структуры и свойств молекулярных систем в газовом и конденсированном состоянии, включающем большое разнообразие методов вычислительной химии, квантовой химии и молекулярного моделирования. Пакетом утилит можно генерировать так называемые cube-файлы (*.cube), описывающие некоторые объёмные данные и положение атомов для молекулярной системы.

Molcas — коммерческое приложение для вычислительной химии, разработанное в качестве совместного проекта рядом международных институтов. Основное внимание в приложении уделено методам расчёта общих электронных структур в молекулярных системах (как в основном, так и в возбуждённом состояниях), используется библиотека для параллельных вычислений Global Arrays (GA).

Molpro — набор утилит на основе библиотеки параллельных вычислений Global Arrays (GA), используется для точных вычислений в квантовой химии. При разработке основное внимание уделяется высокоточным вычислениям, с широким рассмотрением проблемы корреляции электронов посредством взаимодействия конфигурации многовариантности.

MPQC (Massively Parallel Quantum Chemistry) — пакет утилит для проведения параллельных вычислений в квантовой химии и молекулярном моделировании. Пакет утилит является открытым аналогом пакетов вычислительной химии GAMESS и Gaussian, распространяемых под лицензиями с ограничениями (proprietary), бесплатными и условно-бесплатными.

OpenMopac — утилита используемая в вычислительной химии для реализации полуэмпирических алгоритмов квантовой химии. Утилита является свободной версией MOPAC, ставшей распространяться под бесплатной лицензией для академических пользователей и по платной подписке для коммерческого использования.

Orca — пакета утилит вычислительной квантовой химии, основным назначением является расчёт больших молекул, комплексов с переходными металлами, а также UV-Vis и ИК спектров. Результаты вычислений сохраняются в файл особого формата, но могут преобразовываться в cube-файлы (*.cube) и формат XYZ (*.xyz) поддерживаемый большинством приложений для трёхмерного молекулярного моделирования.

Firefly (ранее PCGamess) — набор утилит для квантовохимических расчётов основанный на GAMESS-US и переписанный автором на 60-70% (основной разработчик Александр Грановский), в следствии чего расчёты производятся значительно быстрее чем утилитами оригинального проекта.

Q-Chem — пакет предлагающий передовую всеобъемлющий комплекс инструментов неэмпирической химии для точного прогнозирования молекулярных структур, реактивности, колебательного, электронного спектра и спектра ядерного магнитного резонанса. Пакет включает в себя интегрированный графический интерфейс предусматривающий общие возможности визуализации и генератор ввода, обширный набор функций и методов корреляции. Дополнительно к инструментам вычислительной химии предоставляется универсальная платформа разработки кода.

Gabedit поддерживает наиболее популярные форматы молекул и белковых структур (таких как *.cml, *.cif, *.mol, *.sd, *.sdf, *.pdb, *.ent, *.vis, *.xyz и пр), поддерживается импорт большинство графических форматов (PNG, JPEG, BMP, PPM и др), может автоматически генерировать серию изображений для анимации и многое другое...

Лицензия: BSD (Berkeley Software Distribution license)

Домашняя страница

Страница на sourceforge.net

Страница на github.com (fork original repository)

XDrawChem
Garlic
Автор: posixru
Еще записи по теме
XEphem
XEphem
BrewStillery
BrewStillery
Baudline
Baudline
Sky Chart / Cartes du Ciel
Sky Chart / Cartes du Ciel
KLatexFormula
KLatexFormula
tbclock (terminal binary clock)
tbclock (terminal binary clock)
Оставьте комментарий!

Используйте нормальные имена.

Вы можете войти под своим логином или зарегистрироваться на сайте.

(обязательно)

Рубрики
  • Hовости
  • Изучаем Linux
  • Обзоры Linux ПО
    • Hужное/полезное
    • Аудио и видео ПО
    • Графика
    • Офисное ПО
    • Интернет ПО
    • Образовательные
    • Игры
    • Администрирование
    • Системные утилиты
    • Прочие
    • Shareware / Demo
  • Дистрибутивы
  • Дополнительные материалы
Последние комментарии
Slackel
  • Сергей К » 1. В портеусе и всяких "слаках" есть описане параметров загрузки (Cheatcodes) Где посмотреть?В частности, как...
  • Пётр Иваныч » Самые начинающие линуксоиды приходят из виндёров и умеют читать инф из падающих менюшеки раскрытых оконПО...
  • vovans » Начинающим выбирать бы дистрибутивы попроще и попопулярнее, с хорошей документацией и большим сообществом. Есть де...
  • Серёжа » "Начинающим выбирать бы дистрибутивы попроще..." Читкоды - раз они используются - должны быть задокументирова ны. Как...
  • Аноним » Тех, кто не способен зайти на форум дистра и спросить непосредственно у автора, следует вообще...
noteshrink
  • delameter » Теперь есть плюсовая (не пайтон) версия: //github.com/ ImageProcessing - ElectronicPublications /noteshrink-c/ releasesне думаю что сильно разница будет в производительно сти, преобразование. ..
  • Аноним » преобразовани е то один хрен imagemagick делаетНе угадал ни разу. Даже не близко. К тому же...
SmartCam (Smart Phone Web Camera)
  • Аноним » Armi pistole
ROX Desktop
  • Роман » Содержание статьи не соответствует названию. Это легковесное эссе о рабочих столах, имеющее очень отдаленное отношение...
Scan Tailor
  • звездочёт » У ScanTailor, находящегося в архиве git, есть приемник, продожающий развитие и увеличение возможностей и функционала...
Форум
[26/07/2023 11:17:45]
Музыкальный калейдоскоп
[16/07/2023 12:24:19]
LFS
[17/04/2023 10:14:08]
Тестовая бродилка на Си с ChatGPT
[18/11/2022 11:54:52]
vscode and c/c++
[31/08/2022 12:25:53]
Tor Browser
[22/05/2022 15:45:40]
Стратегии RTS
[30/03/2022 09:05:20]
Заметки с синхронизацией
[01/03/2022 20:15:05]
Говорильня (дискуссионный клуб)
[13/02/2022 11:44:28]
[РЕШЕНО] права на запись в примонтированный образ диска (raw.img)
Облако меток
2D338 3D241 ALSA68 ASCII120 Android1 Arch Linux38 Audio416 Backup80 Benchmark78 Bluetooth2 C++969 CD48 Console1318 DJ-система17 DVD47 Debian28 DjVu22 Enlightenment19 FFmpeg191 FLTK29 FPS40 FREE155 FTP18 FVWM21 Fluxbox40 GIMP24 GNU26 GPS22 GTK1302 GUI801 Gambas11 Games686 Gentoo3 Gnome349 Gstreamer133 HDD122 HDR7 HTML62 Hex-редактор14 ICQ17 IP-сети25 IP-телефон22 IRC31 ISO39 IceWM22 ImageMagick56 JACK99 Jabber35 Java308 JavaScript115 KDE209 LAN29 LXDE37 LaTeX66 Live-CD70 Live-DVD55 Live-USB53 Lua61 MATE32 MEncoder31 MIDI91 MMORPG12 Mail42 Markdown53 Mono53 Mplayer75 MySQL2 OSS9 Open Source14 OpenGL301 Openbox89 P2P51 PDF133 PHP12 Pascal17 Perl102 Phonon27 PulseAudio17 Python759 QT894 RAW34 RPG101 RSS53 RTS42 Roguelike70 Ruby19 Rust15 SDL312 SVG39 Screencast32 Screenshot61 Script78 Slackware66 TOR17 TOX3 Tk39 Torrent67 Ubuntu69 VLC16 Vala64 Web629 WebKit72 WebUI34 WiFi47 Window Maker16 Wine8 XMPP35 Xfce70 Xine14 YouTube80 video4linux27 wxWidgets108 Автоматизация31 Администрирование335 Анонимная сеть47 Антивирус14 Апплет120 Аркада235 Архиватор11 Астрономия36 Аудио конвертер70 Аудио редактор50 Аудиоплеер184 Безопасность243 Бизнес-приложение4 Браузер87 Бродилка203 Бухгалтерия11 Веб-камера36 Видео148
© Zen Way, 2023. Работает на MaxSite CMS | Время: 0.1644 | SQL: 19 | Память: 8.74MB | Вход