Garlic

Garlic — простое C (си) / X11 (libX11) графическое приложение для просмотра и редактирования трёхмерных молекулярных моделей.

Молекулярное моделирование (ММ) — собирательное название методов исследования структуры и свойств молекул вычислительными методами с последующей визуализацией результатов, обеспечивающих их трёхмерное представление при заданных в расчётах условиях.

Garlic был написан для упрощения компьютерного анализа мембранных белков (белки встроенные в клеточную мембрану), но может использоваться для анализа последовательностей белка и в качестве приложения трёхмерного молекулярного моделирования общего назначения.

Garlic ориентирован на командное управление и управление с клавиатуры, можно запустить приложение с нужными параметрами из командной строки, настройки "по умолчанию" можно задать в конфигурационном файле (~/.garlicrc). Исходными данными для визуализации служат координаты атомов молекулы (комплекса молекул) из файлов формата Protein Data Bank / PDB (*.pdb и *.vdb).

Garlic был написан Дамиром Цучичем (Damir Zucic) в качестве дополнения к другим приложениям трёхмерного молекулярного моделирования, например RasMol (OpenRasMol).

Лицензия: GNU General Public License version 2.0 (GPLv2)

Домашняя страница