wxMacMolPlt — удобный C++ / wxWidgets (wxGTK) / OpenGL (GLEW) графический интерфейс (GUI) к пакету вычислительной химии GAMESS / PC GAMESS.
GAMESS-US (General Atomic and Molecular Electronic Structure System) — утилита из пакета вычислительной квантовой химии производящая расчёты при помощи нескольких методов вычислений, разработчик Iowa State University Quantum Chemistry Group.
wxMacMolPlt предоставляет весь необходимый функционал для упрощения визуализации молекулярных структур и обработки результатов квантово-механических расчётов сделанных с помощью GAMESS, без необходимости указания специальных параметров (для GAMESS) или ручного редактирования исходных файлов.
Сделанные GAMESS расчёты сохраняются в текстовой файл специального формата, wxMacMolPlt считывает всю необходимую информацию и визуализирует данные расчётов, таких как энтальпия образования, геометрические параметры, заселённость энергетических уровней, анализ электронной плотности, молекулярные орбитали, анимация колебаний и многое другое.
wxMacMolPlt автоматически определяет тип файла, сначала на основе расширения а затем на основе содержания файла. Если возникнет проблема с имеющимся форматом, то хранящиеся в файле координаты можно преобразовать в необходимый формат с помощью Open Babel (химическая экспертная система).
Открытую в wxMacMolPlt молекулярную структуру можно увеличивать и вращать (вручную или вводя координаты), можно просматривать орбитали, общую плотность электронов и молекулярные электростатические потенциалы, на двухмерной (2D) и трёхмерной (3D) модели. В зависимости от открытых данных визуализация может поддерживать анимацию, оптимизацию геометрии и прочее...
wxMacMolPlt разработан чтобы быть простым в использовании химиком-новичком, но имеется функционал который окажется полезен даже для профессиональных химиков. Просматривать молекулярные структуры можно в оконном и полноэкранном режиме, управление ориентировано на использование мыши, частично поддерживается управление с клавиатуры.
Лицензия: GNU General Public License version 2.0 (GPLv2)
