Linux -- это интересно

Garlic


Рубрика: Образовательные
Метки: | | | |
Просмотров: 634

Garlic — простое C (си) / X11 (libX11) графическое приложение для просмотра и редактирования трёхмерных молекулярных моделей.

Молекулярное моделирование (ММ) — собирательное название методов исследования структуры и свойств молекул вычислительными методами с последующей визуализацией результатов, обеспечивающих их трёхмерное представление при заданных в расчётах условиях.

Garlic был написан для упрощения компьютерного анализа мембранных белков (белки встроенные в клеточную мембрану), но может использоваться для анализа последовательностей белка и в качестве приложения трёхмерного молекулярного моделирования общего назначения.

Garlic ориентирован на командное управление и управление с клавиатуры, можно запустить приложение с нужными параметрами из командной строки, настройки "по умолчанию" можно задать в конфигурационном файле (~/.garlicrc). Исходными данными для визуализации служат координаты атомов молекулы (комплекса молекул) из файлов формата Protein Data Bank / PDB (*.pdb и *.vdb).

Garlic был написан Дамиром Цучичем (Damir Zucic) в качестве дополнения к другим приложениям трёхмерного молекулярного моделирования, например RasMol (OpenRasMol).

Лицензия: GNU General Public License version 2.0 (GPLv2)

Домашняя страница

Комментариев: 2 RSS

Ещё есть DRAWxtl (http://www.lwfinger.net/drawxtl/) и VESTA (http://jp-minerals.org/vesta/en/).

Оставьте комментарий!
Используйте нормальные имена.Войти через loginza
Если вы уже зарегистрированы как комментатор или хотите зарегистрироваться, укажите пароль и свой действующий email.
(При регистрации на указанный адрес придет письмо с кодом активации и ссылкой на ваш персональный аккаунт, где вы сможете изменить свои данные, включая адрес сайта, ник, описание, контакты и т.д.)



 
(обязательно)