ZenWay - Linux сегодня!
  • Главная
  • Форум
  • Контакты
  • Архив
  • Гостевая книга
×
Поиск по сайту
ГлавнаяОбразовательныеXCrySDen

XCrySDen

ОбразовательныеПросмотров: 2976Комментарии: 016 января 2018 г.
2D / 3D / C++ / GUI / ImageMagick / OpenGL / Tk / Комплект инструментов / Просмотрщик изображений / Химия

XCrySDen — легковесное C++ / Tcl / Tk / OpenGL графическое приложение для визуализации молекулярных и кристаллических систем, молекулярного моделирования (ММ).

Молекулярное моделирование (Molecular modelling) — собирательное название методов исследования структуры и свойств молекул вычислительными методами с последующей визуализацией результатов, обеспечивающих их трёхмерное представление при заданных в расчётах условиях.

XCrySDen (Crystalline Structures and Densities and X) написан в 1996 году Антоном Кокальем (Anton Kokalj) по проекту Мауро Кауса (Mauro Causà) для кафедры физической и органической химии института имени Юзефа Стефана, Любляна, Словения (Jozef Stefan Institute, Ljubljana, Slovenia). Первая версия приложения была представлена в 1999 году.

XCrySDen создавался как максимально простой инструмент визуализации, интерфейс ориентирован на быстрое обучение и использование неподготовленными пользователями. Базовые функции визуализации доступны без дополнительного изучения возможностей приложения.

Помимо собственного функционала XCrySDen является графическим интерфейсом для некоторого функционала пакета научных приложений CRYSTAL (расчёты в области квантовой химии твёрдого тела), предоставляет систему визуализации для PWscf / Quantum ESPRESSO (расчет электронной структуры и моделирования материалов), WIEN2k (квантово-механические вычисления) и других приложений использующих Ab initio методы расчётов.

XCrySDen обладает практически всем функционалом необходимым современному молекулярному визуализатору, молекулярные модели могут отображаться в нескольких режимах (каркас, палочки, шары и др), все операции проводятся в реальном времени (вращение, масштабирование и прочее), поддерживается анимация, для визуализации можно задать различные атрибуты (цвета атомов и связей, толщины связей и линий, радиусы атомов и пр).

В дополнение к "стандартным" инструментам молекулярной визуализации XCrySDen поставляется с дополнительным набором функций необходимых для визуализации кристаллических структур. При визуализации можно переключаться между примитивными и обычными настройками ячеек, изменять количество отображаемых единичных ячеек, отображать кристаллическую решетку и многое другое...

XCrySDen поддерживает просмотр молекулярных и кристаллических структур нескольких стандартных форматов (XYZ, PDB и др), для сохранения результата визуализации можно использовать собственный (внутренний) формат XSF (*.xsf), опционально может использоваться химическая экспертная система Open Babel (для расширения количества поддерживаемых форматов).

XCrySDen поддерживает визуализацию химических структур сделанных несколькими сторонними приложениями (GAUSSIAN, CRYSTAL, PWscf, WIEN2k, FHI98MD и ABINIT) и интеграцию с внешними утилитами преобразования (например xsfConvert). Никакого специального графического оборудования для работы приложения не требуется.

Лицензия: GNU General Public License version 2.0 (GPLv2)

Домашняя страница

DRAWxtl
wxMacMolPlt
Автор: posixru
Еще записи по теме
Celestia
Celestia
Genius
Genius
Extcalc
Extcalc
DPUSER / QFitsView
DPUSER / QFitsView
Denemo
Denemo
GeomSpace
GeomSpace
Оставьте комментарий!

Используйте нормальные имена.

Вы можете войти под своим логином или зарегистрироваться на сайте.

(обязательно)

Рубрики
  • Hовости
  • Изучаем Linux
  • Обзоры Linux ПО
    • Hужное/полезное
    • Аудио и видео ПО
    • Графика
    • Офисное ПО
    • Интернет ПО
    • Образовательные
    • Игры
    • Администрирование
    • Системные утилиты
    • Прочие
    • Shareware / Demo
  • Дистрибутивы
  • Дополнительные материалы
Последние комментарии
AbiWord
  • Святой_Мученик_Linux » Некорректно отображает картинки в майкросовтовски х файлах doc. Картинки позиционируются одна на другую, поверх текста. В...
  • vs » К сожалению, AbiWord давно протух и толку от него ровно 0. Даже больше вреда. Сейчас...
tarsnap
  • Анонимус » В тексте опечатка "для использования для использования"
DarGUI / KDar
  • WinGamer » Можно ли забекапить всю систему windows этим архиватором?
cfiles
  • Дмитрий » так эт самое, а как например переименовать папку?
Profanity
  • zon » проше научится свой клиент написать чем разобратся куда что клацать для отправки получения месаг.
  • vovans » Тут не нужно ничего "клацать". Достаточно пару раз на хоткеи посмотреть.
noteshrink
  • Аноним » Теперь есть плюсовая (не пайтон) версия: //github. com/ ImageProcessing - ElectronicPublications /noteshrink-c/ releases
Page dewarp
  • Аноним » Теперь есть плюсовая (не пайтон) версия: //github. com/ ImageProcessing - ElectronicPublications /pagedewarp/ releases
Strawberry Music Player
  • Rododendron » А как добавить радиостанции в плеер? Нигде найти не могу.
Форум
[18/11/2022 11:54:52]
vscode and c/c++
[31/08/2022 12:25:53]
Tor Browser
[26/08/2022 07:57:14]
Музыкальный калейдоскоп
[22/05/2022 15:45:40]
Стратегии RTS
[30/03/2022 09:05:20]
Заметки с синхронизацией
[01/03/2022 20:15:05]
Говорильня (дискуссионный клуб)
[13/02/2022 11:44:28]
[РЕШЕНО] права на запись в примонтированный образ диска (raw.img)
[07/02/2022 13:22:01]
Конвертировать текст набаранный в неправильной раскладке
[04/02/2022 20:35:22]
Редактор тегов
Облако меток
2D338 3D241 ALSA68 ASCII120 Android1 Arch Linux38 Audio416 Backup80 Benchmark78 Bluetooth2 C++969 CD48 Console1318 DJ-система17 DVD47 Debian28 DjVu22 Enlightenment19 FFmpeg191 FLTK29 FPS40 FREE155 FTP18 FVWM21 Fluxbox40 GIMP24 GNU26 GPS22 GTK1302 GUI801 Gambas11 Games686 Gentoo3 Gnome349 Gstreamer133 HDD122 HDR7 HTML62 Hex-редактор14 ICQ17 IP-сети25 IP-телефон22 IRC31 ISO39 IceWM22 ImageMagick56 JACK99 Jabber35 Java308 JavaScript115 KDE209 LAN29 LXDE37 LaTeX66 Live-CD70 Live-DVD55 Live-USB53 Lua61 MATE32 MEncoder31 MIDI91 MMORPG12 Mail42 Markdown53 Mono53 Mplayer75 MySQL2 OSS9 Open Source14 OpenGL301 Openbox89 P2P51 PDF133 PHP12 Pascal17 Perl102 Phonon27 PulseAudio17 Python759 QT894 RAW34 RPG101 RSS53 RTS42 Roguelike70 Ruby19 Rust15 SDL312 SVG39 Screencast32 Screenshot61 Script78 Slackware66 TOR17 TOX3 Tk39 Torrent67 Ubuntu69 VLC16 Vala64 Web629 WebKit72 WebUI34 WiFi47 Window Maker16 Wine8 XMPP35 Xfce70 Xine14 YouTube80 video4linux27 wxWidgets108 Автоматизация31 Администрирование335 Анонимная сеть47 Антивирус14 Апплет120 Аркада235 Архиватор11 Астрономия36 Аудио конвертер70 Аудио редактор50 Аудиоплеер184 Безопасность243 Бизнес-приложение4 Браузер87 Бродилка203 Бухгалтерия11 Веб-камера36 Видео148
© Zen Way, 2023. Работает на MaxSite CMS | Время: 0.1830 | SQL: 19 | Память: 8.73MB | Вход